Gensonde
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Gensonden sind Poly- oder Oligonukleotide (meistens einsträngige DNA, seltener RNA) die eine komplementäre Basensequenz zum gesuchten Gen aufweisen und können sich an die passende DNA-Sequenz einer (immobilisierten) DNA anlagern. Die Stabilität der Anlagerung hängt von der Übereinstimmung der DNA-Sequenzen und Länge der Gensonden bzw. Anzahl der hybridisierten Basen ab. Durch intensives Waschen können alle nicht perfekt homologen Sequenzen wieder getrennt werden, um nur Signale bei exakten Übereinstimmungen zu bekommen.
Sie sind zum Zwecke des Aufspüren oder Detektierens mit Markermolekülen verbunden. Zum Direktnachweis radioaktive Isotope (32P, 35S) oder Fluoreszenzfarbstoffe, zum indirekten Nachweis über Mittlermoleküle z.B. Biotin über Streptavidin oder Antikörper für Digoxigenin. An den "Mittlermolekülen" sind je nach weiteren Detektionsverfahren entweder (Fluoreszenz-)Farbstoffe oder Enzyme gekoppelt. Häufig verwendete Enzyme hierfür sind Alkalische Phosphatase oder Peroxidase.
Gensonden werden entweder detektiert direkt durch Nachweis der radioaktiven Strahlung (Autoradiographie oder Szintillation), oder der entsprechenden Farbstoffe (Fluoreszenzmikroskopie, Photometrie) oder indirekt durch Enzymsubstratreaktion, bei denen entweder Chemoluminiszenz, Farbstoffumschlag oder Farbstoffpräzipitation erzeugt wird. Der Nachweis der Markermoleküle (direkt oder indirekt) gilt als Nachweis der spezifischen Gensonde, die mit der zu analysierenden DNA oder RNA hybridisiert hat.
