Sigma-Faktor
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Ein Sigma-Faktor (σ Faktor) beschreibt in der Protein-Biosynthese von Prokaryoten ein Protein, welches für die Initiation der Transkription notwendig ist.
Der Sigma-Faktor bindet an die Pribnow-Box des Promotors und erhöht damit drastisch die Bindungswahrscheinlichkeit der Polymerase an dieser Stelle, denn die Polymerase kann sich auch so locker an die DNA binden (allerdings ohne zu transkribieren). Nun wird unter Einbau von Nukleotiden die Elongation gestartet, wobei der Sigma-Faktor abgespalten wird.
In E.coli existieren sieben verschiedene Sigma-Faktoren, die z.T. unterschiedliche Promotorspezifitäten aufweisen. Diese Sigma-Faktoren vermitteln die Transkription spezieller Gene unter verschiedenen Umweltbedingungen. So leitet der Sigma-Faktor Sigma32 (32 kDA) die Trankription von Hitzeschockgenen unter Hitzschockbedingungen ein und E.coli ist mit Hilfe der so gebildeten Hitzeschockproteine in der Lage diese Bedingungen zu überleben. Der Haushaltssigma-Faktor Sigma70 leitet die Trankription der unter gewöhnlichen Umweltbedingungen benötigten Gene ein, während beispielsweise SigmaE eine Rolle in der Antwort auf verschiedene Stress-Bedingungen spielt.
Sigma 70: unter normalen Bedingungen; TTGACA
Sigma 32: bei Hitze Streß; CTTGAA
Sigma 54: in Stickstoff haltigen Medien; CTGGCAC
Sigma 28: Flagellenexpression; TAAA
Sigma E: Sporen Bildung; GAACT
[Bearbeiten] Literatur
- Gruber TM, Gross CA. (2003). Multiple sigma subunits and the partitioning of bacterial transcription space. Annu Rev Microbiol. 57, 441-66. PMID 14527287 PDF
- Paget MS, Helmann JD. (2003). The sigma70 family of sigma factors. Genome Biol. 4, 203. PMID 12540296 doi:10.1186/gb-2003-4-1-203 (Volltextzugriff)
- Burgess RR, Anthony L. (2001). How sigma docks to RNA polymerase and what sigma does. Curr Opin Microbiol. 4, 126-31. PMID 11282466
- Helmann JD, Chamberlin MJ. (1988). Structure and function of bacterial sigma factors. Annu Rev Biochem. 57, 839-872. PMID 3052291
