Aptamer

Vikipedi, özgür ansiklopedi

Bu sayfanın Vikipedi standartlarına ulaşabilmesi için
düzenlenmesi gerekmektedir.
Bu madde Mart 2007 tarihinden beri etiketli olarak durmaktadır.

Aptamer

Biyokimya ile ilgili bu madde bir taslaktır. İçeriğini geliştirerek Vikipedi'ye katkıda bulunabilirsiniz.

Aptamerler, spesifik hedef moleküllerine bağlanabilen peptid molekülleri veya oligonükleik asitlerdir. Aptamerler genelde rastgele düzenlenmiş geniş havuzlardaki dizilerden oluşturulmuştur ve mRNA nın yapısında da bulunur.Aptomerler temel araştırmalar ve klinik amaçlar da makromoleküler ilaçlar olarak kullanılabilir.

Aptamerler aşağıdaki gibi sınıflandırılabilirler.

 DNA veya RNA aptamerleri, genelde kısa oligonukleit dizileri içerirler  Peptid aptemerleri, kısa değişken peptide domainleri içerir, protein scafffoldunun iki tarafından tutunurlar.

DNA ve RNA aptamerleri

Aptamerler, laboratuvarda düzenlenmiş birer nükleik asit çeşitleridir, ve SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) yöntemiyle oluşturulurlar bu yöntem yenilemeli bir prosesten oluşur, başlangıç kütüphanesi PCR la çoğaltılır ve RNA ya transkribe edilir. Hedefe spesifik RNA hedef molekülle ilişkiye sokularak belirlenir ve sıkı bağlanan RNA molekülü ortamdan alınarak cDNA ya ters transkribe edilir ve çift sarmal DNA, PCR ile çoğaltılır. Bu zenginleşitirilmiş bağlanma dizileri tekrardan RNA ya transkribe edilir bu operasyon 5 ile 12 arası tekrarlanarak hedef moleküle en sıkı bağlanan RNA seçilmiş olur. Başta küçük moleküller, proteinler, nükleik asitler, hücreler, dokular, organlar olmak üzere çeşitli moleküllere bağlanabilir. Aptamerler, biyoteknolojide ve tedavisel uygulamalarda bazı molekülleri (örneğin, biomolekül, antikor) tanımlama özellikleri sebebiyle kullanılır.Ayrıca çabuk sentezlenmeleri ve bir deney tübünde bile elde edilebilmeleri açısından yaygındırlar.

Peptid aptamerleri

Peptid aptamerleri, hücre içinde diğer protein ilişkilerinin engellenmesi için oluşturulmuş protein yapılardır. Çiftli sarmal yapıdan oluşur, bu sarmal yapı bağlanma affinitesini çok yüksek seviyelere taşır. Kullanım alanları

 Tedavi amaçlı  Hedef onaylama  İlaç seçimi  Yakınlık ayırımı  Diagnostik ve biosensörler