تراصف تسلسلي
من ويكيبيديا، الموسوعة الحرة
في المعلوماتية الحيوية ، تعتبر طريقة التراصف التسلسلي إحدى طرق ترتيب التسلسلات البدئية primary sequence للدنا و الرنا أو حتى البروتينات لتمييز المناطق ذات التشابه المرشحة لتكون نتيجة علاقة وظيفية او بنيوية أو تطورية بين هذه التسلسلات . التسلسلات النيكليوتيدية المتراصفة أو سلاسل الحموض الأمينية المتراصفة تمثل غالبا بصفوف ضمن مصفوفة. كما يتم إدخال فجوات بين الوحدات بحيث تكون الوحدات المتطابقة او المتشابهة متراصفة في اعمدة متعاقبة .
إذا كان لدينا تسلسلين في تراصف ما يتشاركان نفس الأصل (السلف)، فإن التباينات mismatches يمكن ان تفسر على انها طفرات نقطية point mutation و ثغرات مثل إنديل (و هي طفرات إدخال أو إلغاء) يتم إدخالها في سلالة أو سلالتين بوقت واحد .
في التراصف التسلسلي للبروتين ، يمكن تفسير درجة التشابه بين الحموض الأمينية التي تحتل موقعا معينا في تسلسل ما على انها مقياس تقريبي لكيفية انحفاظ منطقة معينة أو sequence motif بين السلالات . غياب الاستبدال أو وجود استبدالات منحفظة جدا فقط (كما في استبدال حموض أمينية لسلاسل جانبية لها خاصيات كيميائية حيوية متشابهة ) ضمن منطقة معينة من التسلسل ، كل هذا يقترح أن هذه المنطقة لها اهمية وظيفية أو بنيوية . و مع ان نيكليوتيدات الدنا و الرنا متشابهة مع بعضها البعض جدا أكثر من الحموض الأمينية ، فإن انحفاظ ازواج الأسس يمكن ان يشير إلى دور بنيوي أو وظيفي أيضا . التراصف التسلسلي يمكن ان يستخدم أيضا لأجل التسلسلات اللاحيوية ، مثل تسلسلات الموجودة في اللغات الطبيعية أو في البينات الاقتصادية .
