Ligaasi
Wikipedia
Ligaasi on entsyymi joka kykenee liittämään DNA-juosteita yhteen muodostamalla kovalenttisia sidoksia juosteiden päiden välille. Toisessa yhteenliitettävässä päässä on oltava 5'-fosfaattiryhmä ja toisessa 3'-OH-ryhmä. Ligaasit ovat tärkeitä geenitekniikan työvälineitä ja yleisimmin käytettävä T4-ligaasi on peräisin Escherichia coli-bakteerista.
[muokkaa] Ligaasin toiminta
Kuvassa kaksi DNA-juostetta ennen ligaasin aiheuttamaa juosteiden yhteenliittymistä. Vapaat OH-ryhmät sijaitsevat punaisella merkityn juosteen ylemmän rihman oikeanpuolimmaisessa tymiinissä (T) ja sinisellä merkityn juosteen alemman rihman vasemmanpuolimmisessa sytosiinissa (C). Vastaavasti vapaat fosfaattiryhmät sijaitsevat punaisella merkityn juosteen alemman rihman oikeanpuolimmaisessa guaniinissa (G) ja sinisellä merkityn juosteen ylemman rihman vasemmanpuolimmaisessa guaniinissa.
Ligaasi yhdistää juosteet niin että ligaasin tekemän liitoksen muodostavat toisen juosteen fosfaattiryhmä ja toisen juosteen OH-ryhmä. Lopputuloksena on ehjä kaksijuosteinen DNA-molekyyli.