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Les stomatophytes (Stomatophyta) sont un sous-clade des embryophytes dans la classification phylogénétique du vivant. Ils regroupent les plantes (Plantae) portant, sur leurs feuilles, des ouvertures appelées stomates pour échanger les gaz respiratoires avec leur environnement, contrairement aux marchantiophytes, qui possèdent des pores aériens.
Les stomatophytes possèdent également une tige visible, ce qui fait d'eux les plantes les plus connues : mousses, fougères, coniférophytes, angiospermes.
