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L'atresia vaginale: deriva dalla mancata canalizzazione del tratto terminale di dotti di Muller, da cui deriva l'organo. Si manifesta generalmente alla pubertà poiché il sangue mestruale non riuscendo a defluire all'esterno, determina ematometro (sangue che si raccoglie in utero), ematosalpinge (sangue nelle tube) causando coliche addominali.