Endonucleasi
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Le endonucleasi sono enzimi idrolitici identificati negli anni settanta che scindono un polinucleotide in due polimeri, a differenza delle esonucleasi che ne distaccano il nucleotide terminale.
Endonucleasi sono coinvolte nella riparazione del DNA e nella maturazione dell'RNA degli Eucarioti Sono endonucleasi sequenza-specifiche gli enzimi di restrizione batterici, che tagliano sequenze particolari di DNA. Spesso tale idrolisi avviene in sequenze palindromiche lunghe circa 4-6 bp e in modo asimmetrico creando delle estremità coesive (ciò permette la generazione di molecole di DNA che si autoassemblano in varie combinazioni), oppure effettuare un taglio centrale creando estremità piatte o "blunt". è un sistema di riconoscimento di DNA estraneo dei batteri, funge da sistema "immunitario" batterico.