Diskussion:GC-Gehalt
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Habe folgenden Satz wieder raus genommen, da er nicht verständlich ist (was ist Basenstapplung?):
- "Es ist aber zu beachten, dass nicht die H-Brücken zur Stabilität beitragen, sondern die Basenstapplung (base-stacking)!"
--Kookaburra 22:22, 6. Dez 2005 (CET)
Vielleicht kann mal jemand einen Artikel zu Basenstapelung schreiben. Ich verstehe nicht ganz, was Wasserstoffbrücken, die im denaturierten Zustand ausgebidet werden, mit den Wasserstoffbrücken zwischen den Basenpaaren im Doppelstrang zu tun haben.
Ich hab' das jetzt mal nachgelesen.
"Jedoch ist die Stabilität nicht von der Anzahl der Wasserstoffbrücken abhängig, denn diese existieren im denaturierten Zustand ebenfalls mit Wasser. Die höhere Stabilität kommt durch grössere Stapelinteraktionen zustande, welche eigentlich durch die Van-der-Waals-Wechselwirkungen erklärt werden können."
Das stimmt so nicht. Für die Kinetik der Denaturierung sind ganz überwiegend die Wasserstoffbrücken zwischen den Basenpaaren entscheidend. Zwar tragen die Interaktionen zwischen benachbarten Basenpaaren ("Basenstapel") ebenfalls zur Stabilität bei, aber wesentlich geringer als die Wasserstoffbrücken. Vor allem habe ich bisher aber keinen Hinweis darauf finden können, dass die Interaktionen zwischen benachbarten G-C-Paaren stärker sind, als zwischen benachbarten A-T-Paaren. Ich würde die zwei Sätze deshalb streichen. --Trance Gemini
einige sätze in diesem artikel sind völlig überflüssig und schwammig formuliert, außerdem in schlechtem deutsch. z.B.: "Diese (regionen hohen GC-gehaltes) sind meist in die (an der?) Aufrechterhaltung der räumlichen Struktur der (von?) Chromosomen einbezogen (beteiligt?)." meint der autor hier centomerregionen? meint er die räumliche Struktur von Chromosomen während der M, G1, S oder G2 Phase? weglassen! es wäre gut den GC gehalt von weiteren spezies hinzuzufügen. D. melanogaster fehlt und die anderen bereits sequenzierten drosophiliden auch. mensch, maus, hund, tribolium sollte auch dazu. man sollte vielleciht auch zwischen codierender und nicht codierender sequenz unterscheiden.
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