Benutzer:Wofl/Kladogramme
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Eine Möglichkeit automatischer Erstellung von Kladogrammen geht über die Erzeugung einer tex-Datei mit Hilfe eines Perl-Skriptes aus einer definierten Eingabesyntax. Ähnlich wie bei der Darstellung mathematischer Formeln kann die Eingabesyntax innerhalb eines Tags (z.B. <klado>...</klado>) im Quelltext untergebracht werden, das als Extension in Mediawiki definiert wird. Bei der Anzeige wird das Tag durch die Bilddatei ersetzt, die aus der tex-Datei erzeugt wurde.
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[Bearbeiten] Eingabeformat
Der Quelltext eines Kladogramms hat folgendes Format:
- Jede Klade (Knoten im Kladogramm) wird als Paar geschweifter Klammern {} dargestellt, die einzelnen Teilbäume (1–n) durch | getrennt
- Endknoten werden durch beliebigen Text dargestellt, der nicht die Zeichen {,},| und # enthalten darf
- Kladen können bezeichnet sein, die Bezeichnung ist ein beliebiger Text, der vor der öffnenden Klammer steht
- Zeilenumbrüche und Leerzeichen können an beliebiger Stelle stehen, es ist damit möglich, die Struktur durch zeilenweise Darstellung und Einrückungen übersichtlich zu gestalten.
[Bearbeiten] Beispiel
Krokodile (Crocodilia)
{Gaviale (Gavialidae)|
Brevirostres
{Echte Krokodile (Crocodylidae)
{Sundagavial (Tomistoma schlegeli) |
Crocodylinae {Stumpfkrokodil (Osteolaemus tetraspis)|Crocodylus}
} |
Alligatoren (Alligatoridae)
{Echte Alligatoren (Alligatorinae)|
Kaimane (Caimaninae)
{Glattstirnkaimane (Palaeosuchus)|
{Echte Kaimane (Caiman) | Mohrenkaimane (Melanosuchus)}
}
}
}
}
[Bearbeiten] Skript klado2tex.pl
Dieses Perl-Skript (im Quelltext als Kommentar) erzeugt aus der Eingabestruktur eine Tex-Datei:
Der Quelltext des Kladogramms wird als Parameter übergeben, die tex-Datei wird in die Standardausgabe geschrieben.
Beispiel (<name> ist ein beliebiger Name einer Datei, die den Quelltext enthält):
klado2tex.pl `cat <name>` > <name>.tex
[Bearbeiten] png-Erstellung
Mit den Befehlen
latex <name>.tex dvipng -gamma 1.5 -T tight <name>.dvi
wird die Bilddatei <name>.png erzeugt.
[Bearbeiten] Ergebnis
Die daraus entstehende Grafik sieht so aus:
[Bearbeiten] Weiteres Beispiel
Systematik der Entelegynae (siehe Echte Webspinnen):
Entelegynae
{Eresidoidea {Eresidae Röhrenspinnen} |
{ {Mimetoidea {Mimetidae} |
Palpimanoidea {Palpimanidae|Huttoniidae|Stenochilidae}
}|
{ {Deinopidae|Radnetzspinnen Araneoidea
{Echte Radnetzspinnen Araneidae |
{ {Baldachinspinnen Linyphiidae | Cyatholipidae} |
{Synotaxidae | {Nesticidae Höhlenspinnen|Haubennetzspinnen Theridiidae}}|
{Dickkieferspinnen Tetragnathidae |
{Theridiosomatidae |
{Mysmenidae |
{Anapidae | Symphytognathidae}
}
}
}
}
}
} |
{Nicodamidae |
{ {Titanoecidae|Phyxelididae} |
{Dictynoidea {Dyctinidae Kräuselspinnen|Neolanidae|Hahniidae|Cybaeidae|Desidae} |
{ {Stiphidoidea {Stiphidiidae} | Agelenoidea {Trichterspinnen Agelenidae}} |
{Amaurobiidae Finsterspinnen |
{Tengellidae |
Jagdspinnen Lycosoidea {Psechridae|Luchsspinnen Oxyopidae|
Raubspinnen Pisauridae|Wolfsspinnen Lycosidae}
}
}
} |
Zodarioidea {Zoodaridae Ameisenjäger} |
Dionycha, Zwei-Klauen-Spinnen
{Glattbauchspinnen Gnaphosidae|
Moderne Laufspinnen
{Sackspinnen Clubionidae|Springspinnen Salticidae|
Krabbenspinnen Thomisidae | Laufspinnen Philodromidae
}
}
}
}
}
}
}
}
ergibt folgendes Kladogramm:
