Biophysique des canaux ioniques
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Les canaux ioniques sont des protéines intégrales de membrane permettant le passage d'ions, molécules ou atomes chargés, à travers la bicouche lipidique, laquelle est strictement imperméable aux molecules chargées. L'espèce diffuse selon son gradient électrochimique. Autrement dit, les canaux sont une voie de passage passive. Ce passage d'ion constitue par définition un courant électrique. En plaçant deux électrodes de part et d'autre de la membrane, il est possible de suivre très précisemment le passage des ions par la mesure du courant électrique associé. Il s'agit de la base de l'électrophysiologie. La vitesse de passage des ions est très élevée, de l'ordre de 107 à 108 ions par secondes.
Les canaux ioniques présentent deux propriétés biophysiques fondamentales :
- La sélectivité. Seule une espèce ionique en général est perméante à travers le pore aqueux traversant la bicouche lipidique.
- Le modele de permeation selon la loi du tout ou rien. Les canaux n'existent que sous deux états, ouvert ou fermé, quel que soit le stimulus d'ouverture. Cette propriete aura d'importantes conséquence lors de la description cinétique des canaux (voir figure).
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[modifier] Sélectivité
La sélectivité permet au canal de "sélectionner" l'espèce diffusible. Cette sélectivite peut être stricte, comme par exemple les canaux sodiques imperméables au potassium. Elle peut etre cationique uniquement, en laissant passer tous les cations monovalents. Cette sélectivité a posé et pose encore des questions non résolues. En effet, il est facile d'imaginer qu'une différence de charge au niveau du filtre de sélectivité puisse expliquer la sélectivité cationique vs. anionique. De même, une différence de taille du pore permettrai de laisser entrer les ions sodiums, plus petits, ~1.9 Å, mais pas les ions potassiums, ~2.6 Å. Qu'en est il de la sélectivité des ions potassiums par rapport aux ions sodium ? Il fallait avoir une image moléculaire d'un canal potassium pour obtenir d'important élements de réponse.
Ce n'est que très récemment qu'un canal potassium bacterien, puis eucaryote, a été cristalisé et sa struture tridimensionnelle obtenue après analyse par diffraction des rayons X. Ces travaux ont valu à Roderick MacKinnon d'être le corécipiendaire du Prix Nobel de chimie en 2003. La structure ainsi obtenue a permis de visualiser l'extraordinaire organisation tridimensionnelle du filtre de selectivité. En effets, l'orientation des molecules d'eau hydratant l'ion potassium est en quelque sorte dictée par l'organisation électronique de l'ion. Le canal fournit par sa structure protéique tridimensionnelle une hydratation similaire. La différence d'énergie entre l'ion hydratée par l'eau et par le canal devient negligeable, ce qui permet donc le processus de passage ionique. Il a en effet été prouvé par des experiences d'éléctrophysiologie que le diamètre du pore canalaire était inferieur au diametre de l'ion hydraté.
[modifier] Ouverture
Il n'existe pas de terme français qui rende compte de ce qui est exprimé par le terme anglo-saxon "gate". Il s'agit de la porte s'opposant au passage ionique mais aussi du phénomène d'ouverture du canal, incluant la transduction du signal d'ouverture.
[modifier] Transduction du signal
Ainsi que precisé plus bas, les mécanismes d'ouverture du canal sont divers. Chaque mécanisme possède ses propres caractéristiques, mais tous ont ceci en commun que le signal doit être, d'une manière ou d'une autre, couplé à la porte.
Notez que la pompe Na+/K+-ATPase est décrite depuis récemment comme un canal à deux gates. Peut-être en est il ainsi de tous les transporteurs ? Les canaux n'ayant eux qu'une seule porte. Notons toutefois l'existence de désensibilisation pouvant faire intervenir une porte supplémentaire et distincte.
[modifier] Stimulus d'ouvertures
- canaux activés pour certaines valeurs du voltage transmembranaire (canal tensiodépendant)
- liaison d'un ligand extracellualaire (récepteur ionotrope)
- canaux activés par le volume cellulaire
- canaux activés par la tension ou le degré d'étirement de membrane
- messager secondaire intracellulaire
[modifier] Liens internes
[modifier] Liens externes
Lauréats du prix Nobel 2003 pour leur travaux sur la structure des canaux
