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Une espèce protégée est une espèce menacée dont le braconnage est interdit par divers organismes.
Les liste des espèces protégées au titre de l'article L.411 du Code de l'Environnement visent à préserver les espèces animales non-domestiques ou végétales non-cultivées lorsqu'un intérêt scientifique particulier ou les nécessités de la préservation du patrimoine biologique national justifient leur conservation. Une série d'arrêtés interministériels fixe les listes limitatives des espèces ainsi protégées et les conditions particulières de leur protection. Toute destruction directe ou toute modification des lieux (aménagement, modification du milieu...), susceptible de faire disparaître ou de nuire à des espèces protégées sont interdites.
Les listes des espèces concernées sont arrêtées au niveau national, régional et parfois au niveau départemental.