Gel d'agarose
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On utilise généralement un gel 1% M/V (1g d'agarose pour 100 ml de volume final) en électrophorèse. Plus on veut un gel discriminant, plus on augmentera le pourcentage d'agarose (3% étant un maximum).
[modifier] Préparation
On pèse 1 gramme d'agarose, et on ajoute la quantité suffisante pour 100 ml de TAE ou de TBE 1x. On verse dans un récipient capable de passer au micro-onde et on fait fondre l'agarose, jusqu'à ce que le liquide soit totalement limpide, sans "traces sirupeuses" en suspension. (généralement le liquide boue, il faut surveiller qu'il ne déborde pas)
On attend que le récipient refroidisse un peu (qu'on puisse le tenir sans se brûler). Le liquide bouillant pourrait déformer les moules en plastiques ou en altérer la transparence. On verse alors le gel dans le moule en y insérant un peigne pour créer les puits de dépôts.
On laisse le gel figer (1/2 heure à 1 heure). On peut alors retirer délicatement le peigne pour libérer les puits, en faisant attention de ne pas en arracher les fonds.
On peut mettre alors le gel dans la cuve d'électrophorèse ou le stocker au frigo dans du tampon (TAE ou TBE).
[modifier] Bromure d'éthidium
On peut ajouter le bromure d'éthidium (B-Et) directement dans le gel (7 µl pour 100 ml) ou préférer faire un bain de coloration au B-Et.
