绿眼虫，又名眼虫藻原生生物之一，是一种生活在淡水中的单细胞生物，兼有动物和植物的特性。喜爱生活在有机质丰富的池沟、湖泊、池塘和溪流中。
绿眼虫全身呈绿色，梭形，体长约60微米，中间宽，两段窄。后段较尖，前端圆。整个身体为一个大细胞，外边包过一个通透性良好的外膜，可以使水、氧气等小分子物质通过。细胞内含叶绿体、眼点、光感受器、伸缩泡等物质。身体后段中间位置有一个球形细胞核。
和其他大部分绿色植物一样，绿眼虫可以进行光合作用，即以光能为原料利用叶绿体，把二氧化碳和水合成糖类来获得营养。根据这些特征，绿眼虫可以归入植物中的鞭毛藻类。
但与其它大部分植物不同的是，绿眼虫可以用自己鞭毛的来回摆动或旋转激动水流和认识自己运动起来，它的光感受器可以使它即使向光度较强的地方运动。如果没有光，它可以通过体表吸收溶解于水中的有机物来获得所需营养。因此，它又可以列入动物中的原生动物门，鞭毛虫类。
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