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- L'éco-épidémiologie vise plus particulièrement l'étude de la répartition dans l'espace et dans le temps et des déterminants écologiques des évènements de santé dans les populations et/ou dans les écosystèmes (ou agrosystèmes).
- Il s'agit de comprendre ou suivre les facteurs environnementaux expliquant, permettant et/ou favorisant la maladie.
- Le contexte peut être l'environnement "naturel" ou un environnement plus artificiel (la ville, la maison ou encore l'élevage..).
- L'éco-épidémiologie se veut systémique, intégrative et holistique. Elle est donc pluridisciplinaire, pouvant concerner tant la médecine humaine que vétérinaire, ou avoir des applications phytosanitaires ou dans le domaine de la santé des écosystèmes ou de la qualité de l'environnement.
- L'éco-épidémiologue cherche à cerner la dynamique du complexe écopathogène, c'est à dire de l'ensemble des organismes en interaction participant directement ou indirectement à l’expression d’une maladie dans un contexte environnemental (spatial et temporel) donné.
- Il peut aussi s'intéresser aux fonctions d'évènements qui peuvent sembler être des maladies, mais qui parfois chez l'animal, la plante ou chez une association symbiotique d'organismes est une réponse à un stress ou à une modification de l'environnement.
- Il s'intéresse notamment aux interactions durables entre pathogène ou parasite et hôte (dont relations co-évolutives).