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Le parc naturel régional du Haut-Jura a été créé le 10 février 1986 et regroupait alors 37 communes. On dénombre maintenant (2005) 113 communes adhérentes, qui compte au total 71 000 habitants
Il s'étend sur une superficie de près de 165 000 hectares à travers trois départements : l'Ain, le Doubs et le Jura. Aux extrémités du parc sont définies des villes-portes, qui ne se situent pas à proprement parler dans le Haut-Jura, mais qui de par leur positionnement géographique sont des points de passage importants pour y accéder. Ces villes sont : Divonne-les-Bains, Gex, Bellegarde-sur-Valserine, Champagnole, et la communauté de communes d'Oyonnax.
