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Sabinien est probablement né à Blera (Bieda) près de Viterbe, en Italie, et fut consacré pape à la date probable du 13 septembre 604.
Il fut envoyé comme nonce apostolique à Constantinople par Grégoire le Grand, mais ne s’acquitta pas de manière satisfaisante de cette charge et retourna à Rome en 597.
Il devint impopulaire à cause de son sens déraisonnable de l’économie, bien que le Liber Pontificalis indique qu’il distribua du grain au cours d’une famine à Rome sous son pontificat. L’érudit italien Augustin Onofrio Panvinio (1529-1568), dans son Epitome pontificum Romanorum (Venise, 1557) lui attribue l’introduction de la la coûtume de sonner les cloches aux heures canoniques et lors de la célébration de l’Eucharistie.