Superoxyde dismutase

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Structure de l'unité monomérique de la Mn-SOD humaine

La superoxyde dismutase (SOD, numéro EC : 1.15.1.1), est une métalloprotéine avec une activité enzymatique: la catalyse de la dismutation du superoxyde en oxygène et péroxyde d'hydrogène. Pour cette raison, cette enzyme est une partie importante du système de défense contre les radicaux libres. Elle est présente dans presque tous les organismes aérobies. Une des rarissimes exceptions est Lactobacillus plantarum et les Lactobacillus apparentés, qui n'en possèdent pas et utilisent un mécanisme de défense différent.

Sommaire

1 Cofacteurs métalliques
- 1.1 Réaction catalytique
2 Les SOD dans les êtres vivants
- 2.1 Être humain
3 Physiologie
- 3.1 Mutations
4 Utilisation cosmétique
5 Voir aussi
- 5.1 Notes et références
- 5.2 Bibliographie
6 Liens externes

[modifier] Cofacteurs métalliques

Il existe quatre types de superoxydes dismutases selon les ions cofacteurs : cuivre et zinc ; manganèse ; fer ; nickel.

[modifier] Réaction catalytique

La dismutation du superoxyde catalysée par les SOD peut être écrite à l'aide des deux demi-réactions suivantes :

M⁽ⁿ⁺¹⁾⁺ − SOD + O₂⁻ → Mⁿ⁺ − SOD + O₂
Mⁿ⁺ − SOD + O₂⁻ + 2H⁺ → M⁽ⁿ⁺¹⁾⁺ − SOD + H₂O₂.

où M = Cu (n=1) ; Mn (n=2) ; Fe (n=2) ; Ni (n=2).

Dans cette réaction, l'état d'oxydation de l'élément métallique M oscille entre n et n+1. Dans l'enzyme à cuivre et zinc, le zinc n'a pas de rôle catalytique.

Structure du site actif de la Mn-SOD mitochondriale humaine

[modifier] Les SOD dans les êtres vivants

La localisation chez les êtres vivants des différents types de SOD est discutée dans cette section.

Le cytosol de presque toutes les cellules eucaryotes contient la forme à [cuivre]]-zinc de la SOD (CuZn-SOD). (Par exemple, la CuZn-SOD qui est disponible comme produit commercial est purifiée à partir des globules rouges bovins : PDB 1SXA, EC 1.15.1.1). L'enzyme à Cu-Zn est un homodimère de poids moléculaire de 32 500 daltons.

Les deux sous-unités interagissent principalement par des mécanismes hydrophobes et électrostatiques. Les ligands du cuivre et du zinc sont des chaînes latérales d'histidine.

Les mitochondries des cellules eucaryotes, et beaucoup de bactéries (par exemple E. coli) contienne une SOD à manganèse (Mn-SOD). (Par exemple, le Mn-SOD mitochondriale humaine: PDB 1N0J, EC 1.15.1.1). Les ligands du manganèse sont trois chaines latérales d'histidine, une chaine latérale d'aspartate et une molécule d'eau ou un ion OH^- suivant l'état d'oxydation du manganèse (respectivement II et III).

E. coli et d'autres bactéries contiennent aussi la forme à fer de l'enzyme. Certaines bactéries contiennent la Fe-SOD d'autres la Mn-SOD, et certaines contiennent les deux ou des SOD cambialistiques pouvant fonctionner soit avec le Fe, soit avec le manganèse en fonction de la biodisponibilité des cations de ces métaux. Fe-SOD d'E. coli: PDB 1ISA, EC 1.15.1.1). Les sites actifs de la Mn-SOD et de la Fe-SOD contiennent le même type de chaînes latérales et ont quasiment la même structure.

[modifier] Être humain

Chez l'être humain, il y a coexistence de trois formes de SOD. Un type de CuZn-SOD (SOD1) se trouve dans le cytoplasme, la Mn-SOD (SOD2, ) dans les mitochondries et un deuxième type de CuZn-SOD (SOD3) est extracellulaire. Les gènes correspondant aux SOD1-3 se trouvent respectivement dans les chromosomes 21, 6 et 4 (21q22.1, 6q25.3 et 4p15.3-p15.1).

[modifier] Physiologie

Voir l’article Radical libre.

Le radical-anion superoxyde O₂^-) dismute spontanément en O₂ et H₂O₂ mais, dans les conditions physiologiques, la vitese de cette réaction bimoléculaire est faible et le temps de vie du superoxyde est suffisamment long pour qu'il puisse soit oxyder des composants des macromolécules biologiques (ADN, protéines …), soit générer d'autres espèces réactives oxygénées bien plus toxiques que le superoxyde lui-même (telles que le péroxynitrite en réagissant avec NO ou le radical hydroxyle en réagissant avec le H₂O₂).

Pour éviter la toxicité du superoxyde et de ses dérivés, l'évolution a permis d'obtenir des SOD hautement efficaces. La CuZn-SOD a la plus grande constante de vitesse catalytique connue pour une enzyme, k_cat=~10⁹ M^-1 s^-1). La réaction entre la CuZn-SOD et le superoxyde n'est limitée que par la diffusion du superoxyde vers le site actif de l'enzyme. Les autres SOD sont légèrement moins efficaces (k_cat=~10⁸ M^-1 s^-1.)

Dans les conditions normales, la SOD réduit efficacement la concentration de superoxyde dans les tissus vivants, empêchant la toxicité du superoxyde de se manifester.

[modifier] Mutations

L'importance physiologique des SOD a été mise en évidence à l'aide d'études réalisées sur des lignées de souris génétiquement modifiées dans lesquelles un des types de SOD a été inactivé.

Effets des mutations :

Les souris dépourvues de SOD1 (CuZn-SOD cytosolique) développent une grande quantité de pathologies parmi lesquelles des cancers du foie, une accélération de la perte de masse musculaire avec l'âge, une incidence précoce de la cataracte et une espérance de vie réduite.
Les souris dépourvues de SOD2 (Mn-SOD) meurent quelques jours après la naissance dans des conditions de stress oxydant massif.
Les souris dépourvues de SOD3 ne présentent, par contre, aucune anomalie visible.

[modifier] Utilisation cosmétique

Une étude^[1] décrit une utilisation possible de la CuZn-SOD pour réduire le stress oxydant subi par la peau, par exemple pour réduir la fibrose causée par les traitements radiologique du cancer du sein. Toutefois, cette étude n'est que préliminaire, en raison de limitations du protocole expérimental (pas de double aveugle, ni de groupe placébo).

[modifier] Voir aussi

Catalase

[modifier] Notes et références

↑ F. Campana, Topical superoxide dismutase reduces post-irradiation breast cancer fibrosis, J. Cell. Mol. Med., 2004, 8(1), 109-116. Texte en accès libre - PDF 333kB