TRNA
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tRNA tRNA為Transfer_RNA的簡稱,又称转运RNA、转移RNA,是小RNA分子,能夠在轉譯時,攜帶特定的氨基酸到正再加上氨基酸的多肽鏈(polypeptide chain)的ribosomal site上。tRNA能認得特定的密碼子,有個能使氨基酸接附在其上的位置。藉由反密碼子使得每個tRNA能辨識的密碼子均不同。(反密碼子包含一段與mRNA上一段互補的序列)每個tRNA分子理論上只能與一種氨基酸接附,但是遺傳密碼有简并性(degenerate),使得有多於一個以上的tRNA可以跟一種氨基酸接附。 按照Francis Crick的假设,tRNA是一种“适配”分子,介导mRNA序列上密码子的识别,并且翻译成相应的氨基酸。
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[编辑] tRNA的結構
tRNA為74~95個鹼基的小片段RNA鏈,會折疊成苜蓿葉狀的二級結構。 tRNA有一级结构(5'到3'的核苷酸方向),二级结构(通常显示为三叶草结构)和四级结构(所有的tRNA具有类似L-形的三维结构,允许它们与核糖体的P、A位点结合)。
[编辑] 特色
- 5'端磷酸。
- 受体臂accept stem,(也被稱作amino acid stem)是一個7個鹼基長的stem,其中包含5'端,與有3'端羟基OH(能結合胺基酸於其上)的3'端。受体臂有可能含有非華生-克裡克所發現的鹼基對。
- CCA尾(CCA tail)是tRNA分子3'端的CCA序列,在翻译时,酶识别tRNA是重要的。
- D臂(D arm)是在一个环(D loop)的端部4个碱基的臂,通常含有二氢尿嘧啶(dihydrouridine)。
- 反密码子臂(anticodon arm)有5个碱基,包括反密码子(anticodon)。每一tRNA包括一个特异的三联反密码子序列,能够与氨基酸的一个或者多个密码子匹配。例如赖氨酸(lysine)的密码子之一是AAA,相应的tRNA的反密码子可能是UUU(一些反密码子可以与多于一个的密码子匹配被称为“摆动”)。
- T臂(T arm)是5个碱基的茎,包括序列TψC。
- 修饰碱基(Modified bases)是tRNA中的一些不常见的碱基,如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修饰形式。
[编辑] 氨酰化
氨酰化Aminoacylation是添加一个氨酰基团到化合物的过程。
在氨酰tRNA合成酶(aminoacyl tRNA synthetase)的作用下,tRNA与特异的氨基酸进行氨酰化反应(aminoacylated)。对于一种氨基酸而言,尽管可能有多种tRNA和多种反密码子,但是通常只有一种氨酰tRNA合成酶。合成酶对合适的tRNA的识别不仅仅是反密码子,受体臂也起了显著的作用。
反应:
- amino acid + ATP → aminoacyl-AMP + PPi
- aminoacyl-AMP + tRNA → aminoacyl-tRNA + AMP