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L'épistémologie de la médecine (ou épistémologie médicale) est une réflexion sur la science médicale, c'est à dire sur la partie scientifique (connaissance médicale) de la médecine qui est à la fois une science (scientificité de la médecine) et une pratique (praxis) (pratique médicale).
L'épistémologie médicale s'intéresse à la construction de la connaissance médicale (ontologie médicale) et sur le processus d'émergence, d'évolution et de disparition des entités médicales: maladies, lésions, signes cliniques, syndromes cliniques...
