核融合科学研究所（かくゆうごうかがくけんきゅうじょ、 National Institute for Fusion Science）は、自然科学研究機構を構成する岐阜県土岐市にある大学共同利用機関。
1989年に、名古屋大学プラズマ研究所を改組、京都大学ヘリオトロン核融合研究センターおよび広島大学核融合理論研究センターの一部を統合することにより設立された。
マスコットはプラズマくん。
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