ケモインフォマティクス
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ケモインフォマティクス（Cheminformatics）はコンピュータと情報化技術を用いて、化学領域の問題に適用する方法論である。ケモインフォマティクスおよび化学情報の技術は医薬品化学の創薬研究過程でも利用されている。
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[編集] 基本
ケモインフォマティクスは化学領域と情報工学領域の融合した学際領域で、特に化学におけるグラフ理論（Bonchev/Rouvray, 1990）や化学物質空間のデータ探索に関する研究が盛んである。化学物質空間は少なくとも1062個の分子構造が存在すると見積もられている（Lahana, 1999）。それに比して、2005年現在既知の化学物質の総数は109程度である。
[編集] 応用
[編集] 検索
計算機化学の技術を使用して巨大な化合物のin silico virtual librariesを構築すると、化学物質空間のデータ探索に効果的である。
[編集] 定量的構造活性相関 (QSAR)
定量的構造活性相関や定量的構造属性相関（en:QSPR）の値を算出し化合物の活性をその分子構造から推定するのに用いられる。
[編集] ファイルフォーマット
「In silico」の化学構造を表す内部表現形として, XML技術に基づいたChemical Markup LanguageやSMILES記法などが使用される。この内部表現形は巨大な化学データベースにおいて外部とデータ交換する際にも使用される。 化学データベースに詳しい。
[編集] 関連項目
[編集] 成書
- D. Bonchev, D.H. Rouvray: Chemical Graph Theory: Introduction and Fundamentals. Gordon and Breach Science Publishers, 1990, ISBN 0-85626-454-7.
- R. Lahana: How many leads from HTS?. Drug Discovery Today, 1999, 4, 447-448. DOI: 10.1016/S1359-6446(99)01393-8.
- Gasteiger J.(Editor), Engel T.(Editor): Chemoinformatics : A Textbook. John Wiley & Sons, 2004, ISBN 3-52730-681-1
- Gasteiger J.(Editor), Engel T.(Editor): Chemoinformatics : A Textbook. John Wiley & Sons, 2004, ISBN 3-52730-681-1
日本語で読めるものとしては、
- J.Gasteiger・T.Engel編、船津公人監訳：ケモインフォマティクス -予測と設計のための化学情報学- 丸善株式会社(2005)
[編集] 関連項目
- バイオインフォマティクス
- 計算機化学
- Chemical file format
[編集] 外部リンク
- Comprehensive cheminformatics link list and data set repository:（英語）http://www.cheminformatics.org
- A cheminformatics glossary:（英語） http://www.genomicglossaries.com/content/chemoinformatics_gloss.asp
- XML- CML.ORG - The Site for Chemical Markup Language:（英語） http://www.xml-cml.org/
- VCCLAB Virtual Computational Chemistry Laboratory:（英語） http://www.vcclab.org
- Accelrys Software Inc. http://www.accelrys.com/jp/chem/index.html
- ELSEVIER MDL（英語） http://www.mdli.com/solutions/index.jsp
- パトコア（日本語） http://www.patcore.com/cheminfo/index.html
