ゲノムプロジェクト

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ゲノムプロジェクトとは、シークエンシングによって生物のゲノムの全塩基配列を解読しようとするプロジェクト。ヒトをはじめ、マウスや線虫などのモデル生物が主な対象であるが、イネや小麦などの主要農産物については企業による解読が目立つ。

[編集] ゲノムプロジェクトとモデル生物の一覧

[編集] 後生動物 Metazoa

節足動物 Arthropoda:
- ネッタイシマカ（デング熱）Aedes aegypti
- ヒトスジシマカAedes albopictus
- Aedes triseriatus
- マダニ Amblyomma americanum
- ハマダラカ (マラリア) Anopheles gambiae: 2002年10月
- ミツバチApis mellifera ligustica
- カイコBombyx mori:2004年2月29日
- アカイエカ Culex pipiens
- キイロショウジョウバエ Drosophila melanogaster：2000年3月24日: BDGP, Celera
- ツェツェバエ（トリパノソーマ）Glossina morsitans

脊索動物 Chordata:
- ウシ Bos taurus: 進行中
- イヌ Canis familiaris
- ウマ Equus caballus: 進行中
- ネコ Felis catus: 進行中
- ヒト Homo sapiens
- マウス Mus musculus:
- チンパンジー Pan troglodytes
- ラット Rattus norvegicus：2004年4月1日
- イノシシ、ブタ Sus scrofa
- ニワトリ Gallus gallus
- アフリカツメガエル Xenopus laevis
- アフリカツメガエル Xenopus tropicalis
- ゼブラフィッシュ Danio rerio
- トラフグ Fugu rubripes: 365 million bp
- ミドリフグ Tetraodon nigroviridis
- カタユウレイボヤ Ciona intestinalis

線形動物 Nematoda:
- マレー糸状虫（フィラリア）Brugia malayi
- Caenorhabditis briggsae
- Caenorhabditis elegans: 1998年: 100.274 Mb: サンガーセンター、ワシントン大学

吸虫 Trematoda:
- 日本住血吸虫 Schistosoma japonicum
- マンソン住血吸虫 Schistosoma mansoni

[編集] 植物 Plantae

シロイヌナズナ Arabidopsis thaliana
トマト Lycopersicon esculentum
タルウマゴヤシ Medicago truncatula
イネ Oryza sativa
ミヤコグサ Lotus japonicus
ポプラ Populus trichocarpa

[編集] 菌類 Fungi

子嚢菌　Ascomycota:
- アスペルギルスAspergillus fumigatus
- アスペルギルスAspergillus nidulans
- アスペルギルスAspergillus parasiticus
- アスペルギルスAspergillus terreus
- カンジダCandida albicans
- カンジダCandida glabrata CBS138
- Debaryomyces hansenii
- Fusarium sporotrichioides
- イネバカナエ菌病菌Gibberella zeae PH-1
- Kluyveromyces lactis
- アカパンカビNeurospora crassa
- ニューモシスチス・カリニ（カリニ肺炎）Pneumocystis carinii
- 出芽酵母 Saccharomyces cerevisiae
- 分裂酵母 Schizosaccharomyces pombe
- Yarrowia lipolytica
担子菌 Basidiomycota:
- クリプトコッカスCryptococcus neoformans
- Phanerochaete chrysosporium
微胞子虫 Microsporidia:
- Encephalitozoon cuniculi

[編集] 原生生物

アピコンプレックス門Apicomplexa:
- Babesia bovis
- Eimeria tenella
- クリプトスポリジウムCryptosporidium parvum
- クリプトスポリジウムCryptosporidium hominis TU502
- Plasmodium berghei
- Plasmodium chabaudi
- 熱帯熱マラリア原虫（マラリア）Plasmodium falciparum
- サルマラリア原虫Plasmodium knowlesi
- 三日熱マラリア原虫（マラリア）Plasmodium vivax
- Plasmodium yoelii
- Theileria annulata
- Theileria parva
- トキソプラズマToxoplasma gondii

Bacillariophyta（珪藻）:
- Thalassiosira pseudonana

Cryptophyta:
- Guillardia theta

Dictyosteliida:
- Dictyostelium discoideum

Diplomonadida:
- ランブル鞭毛虫Giardia lamblia

Entamoebidae:
- 赤痢アメーバEntamoeba histolytica

Rhodophyta（紅藻）:
- Porphyra yezoensis
- シアニディオシゾン Cyanidioschyzon merolae

Kinetoplastida:
- リーシュマニア（カラアザール）Leishmania major
- ガンビアトリパノソーマ（アフリカ睡眠病）Trypanosoma brucei
- クルーズトリパノソーマ（シャーガス病）Trypanosoma cruzi

[編集] 原核生物

原核生物では、真正細菌は141種、古細菌は18種でゲノム解読が終了している。大腸菌のように複数の株で読まれているものもあるので、正確には生物種としてはもう少し少ない。

[編集] 細胞内小器官

葉緑体やミトコンドリアもそれぞれ独自にゲノムを持っており、これらについてのゲノムプロジェクトも進行している。

[編集] ウイルス

ウイルスは宿主の遺伝子に依存しているため、ゲノムが短く、非常にはやくゲノム解読が終了する。2004年4月10日現在、1274種類のゲノムが解読済み。最近ではSARSウイルスで行われた。

[編集] 関連項目

[編集] 外部リンク

ゲノムプロジェクト進行状況データベース(英語)

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