Aminosyre
Fra Wikipedia, den frie encyklopædi
I kemi er en aminosyre ethvert molekyle, som indeholder både en aminogruppe og carboxylsyregruppe.
I biokemi bliver den kortere og mere generelle term aminosyre hyppigt anvendt om alfa-aminosyrer. En alfa-aminosyre er en aminosyre hvor amino- og carboxylsyregruppen er forbundet til samme carbonatom. Nogle molekyler som prolin indeholder ikke en aminogruppe og er derfor ikke kemisk set en aminosyre. Teknisk set er proline en iminosyre, men bliver også klassificeret som en aminosyre, fordi den har funktionelle ligheder med ægte aminosyrer i celler.
Alfa-aminosyrers generaliserede struktur er NH2-CHR-COOH hvor "R" repræsenterer en sidekæde, der er specifik for den enkelte aminosyre. Aminosyrer klassificeres sædvanligvis i 4 grupper ud fra sidekædernes egenskaber: sure, basiske, hydrofile (polære) og hydrofobe (upolære).
Aminosyrer kan forekomme i to forskellige optiske isomerer kaldet D og L; L-aminosyrer repræsenterer langt størstedelen af aminosyrerne i proteiner. Aminosyren glycin har "R" lig med H, så den har ikke en optisk isomer. D-aminosyrer bliver kun fundet i proteiner produceret af eksotiske havorganismer, f.eks. enkelte snegle. Proteiner dannes ved polymerisation af aminosyrer som danner peptidbindinger til hinanden i en proces kaldet translation:
1. aminosyre; 2, zwitterion struktur; 3, to aminosyrer som sidder sammen via en peptidbinding (den fede streg).
20 aminosyrer er repræsenteret i den genetiske kode:
 Alanin (Ala / A) |
 Arginin (Arg / R) |
 Asparagin (Asn / N) |
 Asparaginsyre (Asp / D) |
 Cystein (Cys / C) |
 Glutaminsyre (Glu / E) |
 Glutamin (Gln / Q) |
 Glycin (Gly / G) |
 Histidin (His / H) |
 Isoleucin (Ile / I) |
 Leucin (Leu / L) |
 Lysin (Lys / K) |
 Methionin (Met / M) |
 Fenylalanin (Phe / F) |
 Prolin (Pro / P) |
 Serin (Ser / S) |
 Threonin (Thr / T) |
 Tryptophan (Trp / W) |
 Tyrosin (Tyr / Y) |
 Valin (Val / V) |
Sidekædernes kemiske egenskaber er:
| Forkort. | Fulde navn | Sidekæde type | Masse | Isoelektrisk punkt | Bemærkninger | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A | Ala | Alanin | hydrofob | 89,09 | 6,11 | |
| C | Cys | Cystein | hydrofil | 121,16 | 5,05 | To cysteiner kan danne en disulfidbinding. |
| D | Asp | Asparaginsyre | syre | 133,10 | 2,85 | |
| E | Glu | Glutaminsyre | syre | 147,13 | 3,15 | |
| F | Phe | Phenylalanin | hydrofob | 165,19 | 5,49 | Essentiel |
| G | Gly | Glycin | hydrofil | 75,07 | 6,06 | Glycin er ikke optisk aktivt fordi der er to hydrogenatomer på α-carbonatomet. |
| H | His | Histidin | basisk | 155,16 | 7,60 | Essentiel for børn |
| I | Ile | Isoleucin | hydrofob | 131,17 | 6,05 | Essentiel |
| K | Lys | Lysin | basisk | 146,19 | 9,60 | Essentiel |
| L | Leu | Leucin | hydrofob | 131,17 | 6,01 | Essentiel |
| M | Met | Methionin | hydrofob | 149,21 | 5,74 | Essentiel |
| N | Asn | Asparagin | hydrofil | 132,12 | 5,41 | |
| P | Pro | Prolin | hydrofob | 115,13 | 6,30 | Kan bryde proteinfoldingsstrukterer som α helix eller β sheet. |
| Q | Gln | Glutamin | hydrofil | 146,15 | 5,65 | |
| R | Arg | Arginin | basisk | 174,20 | 10,76 | Essentiel |
| S | Ser | Serine | hydrofil | 105,09 | 5,68 | |
| T | Thr | Threonin | hydrofil | 119,12 | 5,60 | Essentiel |
| V | Val | Valin | hydrofob | 117,15 | 6,00 | Essentiel |
| W | Trp | Tryptophan | hydrofob | 204,23 | 5,89 | Essentiel |
| Y | Tyr | Tyrosin | hydrofil | 181,19 | 5,64 | |
| Amino Syre |
hydrofob | positive | negative | polær | ladet | lille | småt | aromatisk | alifatisk | van der Waals-volumen |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ala | X | - | - | - | - | X | X | - | - | 67 |
| Cys | X | - | - | - | - | X | - | - | - | 86 |
| Asp | - | - | X | X | X | X | - | - | - | 91 |
| Glu | - | - | X | X | X | - | - | - | - | 109 |
| Phe | X | - | - | - | - | - | - | X | - | 135 |
| Gly | X | - | - | - | - | X | X | - | - | 48 |
| His | X | X | - | X | X | - | - | X | - | 118 |
| Lys | X | X | - | X | X | - | - | - | - | 135 |
| Ile | X | - | - | - | - | - | - | - | X | 124 |
| Leu | X | - | - | - | - | - | - | - | X | 124 |
| Met | X | - | - | - | - | - | - | - | - | 124 |
| Asn | - | - | - | X | - | X | - | - | - | 96 |
| Pro | - | - | - | - | - | X | - | - | - | 90 |
| Gln | - | - | - | X | - | - | - | - | - | 114 |
| Arg | - | X | - | X | X | - | - | - | - | 148 |
| Ser | - | - | - | X | - | X | X | - | - | 73 |
| Thr | X | - | - | X | - | X | - | - | - | 93 |
| Val | X | - | - | - | - | X | - | - | X | 105 |
| Trp | X | - | - | X | - | - | - | X | - | 163 |
| Tyr | X | - | - | X | - | - | - | X | - | 141 |
[redigér] Eksterne henvisninger
- BioSite. Biokemisk leksikon.
- New Amino Acid Debuts
- Newswise: 22nd Amino Acid Discovered: Comment from U of Utah Citat: "...Gesteland said discovery of the 22nd genetically encoded amino acid raises the bigger question of how life's genetic code is reprogrammed to do new things, and also suggests "there may be other surprises out there. Are there yet other amino acids?"..."
