細菌叢調査

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細菌叢調査（さいきんそうちょうさ）(Enviromental Sampling)とは、ある環境中に存在するであろう細菌、ウイルス、原虫などを調査するものである。「細菌叢」と呼ばれるが、単に細菌ではなく、広く「微生物」を対象としている。それ故、単に細菌調査、環境（微生物）調査や（環境）サーベイランスと呼ばれることもある。

調査は、医学、歯学、薬学はもとより、栄養学、理学、農学など幅広い分野の研究者が従事している。

[編集] 主な調査キット

細菌叢調査には企業が開発販売されているキットを用いることが一般的である。
- ふきふきチェック（栄研器材株式会社）
- ぺたんチェック（栄研器材株式会社）
- N－IDテスト・SP－18「ニッスイ」（日水製薬）

N-IDテスト

[編集] 分析機器・器具

培地（一般増殖用培地）
- 寒天培地
- 血液寒天培地
- チョコレート培地
- GMA培地
- ミュラーヒントン培地
- チオグリコール酸塩培地
- クックドミート培地
特殊菌増殖用・分離用培地
- マンニット食塩培地（ブドウ球菌）
- No.110培地（ブドウ球菌）
- トッド・ヒューウイット培地（レンサ球菌）
- MS培地（口腔内レンサ球菌）
- EF培地（腸球菌）
- NAC培地（緑膿菌）
- 荒川培地（ジフテリア菌）
- サブロー培地（真菌）
- コーンミール培地（カンジダ）
- カンジダGS培地（カンジダ）
- B-CYE培地（レジオネラ）
- 小川培地（結核）
- デュボス培地（結核）
- ソートン培地（結核）
- PPLO培地（マイコプラズマ）
- ボルデージャクソン培地（百日咳菌）
- サイアーマーチン培地（淋菌）
- SS培地（サルモネラ、赤痢）
- TCBS培地（サルモネラ、赤痢）
- CW培地（ウェルシュ菌）
- LBS培地（乳酸菌）
- スキロー培地（カンピロバクター）
- バツラー培地（カンピロバクター）

器具・材料
- 白金耳
- 試験管
- ピペット
- スポイト
- スピッツ
- 遠沈管
- エッペンドルフチューブ
- ガスバーナー
- 竹串
- 生理食塩水

機器
- 遠心分離機
- 電子顕微鏡／光学顕微鏡
- ふ卵器／インキュベーター

[編集] 染色法

グラム染色
免疫染色
莢膜染色
墨汁法（Indian Ink法）

[編集] 分析方法

生化学試験
- コアグラーゼ試験
- バシトラシン感受性試験
- キャンプ試験
- グルデン試験
- コード形成試験
血清反応試験
- ヴィダール反応
- ワッセルマン反応
- ワイル・フェリックス反応
- アスコリ試験
皮内反応
- 遅延型アレルギー反応
- 毒素・抗毒素反応

[編集] 主な調査報告

オフィス
- アメリカのアリゾナ大学がオフィス内にある電話機や机などに付着する細菌を調査した結果、電話の受話器で1平方インチ当たり2,5127個、机が2,0961個、キーボードが3295個、マウスで1676個の細菌を検出した。同様に調査をトイレの便座を行った結果、49個であった。つまりオフィスはトイレの便座よりも数百倍多い数の細菌が確認された。（参考：2002年にCNNより配信された）
レスリングマット
- レスリングマットの細菌調査を行った結果、87～93%がグラム陽性球菌であった。また、日和見感染の起因菌であるStaphylococcus epidermidisなどが同定された。（参考文献：三星暢公、長船哲斎、田中和幸、藤本英男、伊藤孝「自動細菌同定検査装置によるレスリングマットの細菌の分離同定」（財）緒方医学化学研究所、医学と生物学第147巻第3号：p.37～40、2003）
洗面所
- 学生などが使用する洗面所の細菌叢調査を行った結果、大腸菌の検出は希であり、70％エタノールで消毒後は、劇的に細菌数が減った。（参考文献：清水英世、渡辺優子「洗面所の細菌汚染状況について」岐阜市立女子短期大学、岐阜市立女子短期大学紀要第52巻：p.107～108、2003）
医師のネクタイ
- 2004年にアメリカのルイジアナ州で開催されたアメリカ微生物学会において、イスラエルの研究者が医師のネクタイに黄色ブドウ球菌などの病原菌が潜み、感染の運び役になっているとの報告がなされた。
医師のボールペン
- 医師が使用している文具（ボールペンなど）に対して細菌叢調査を行った結果、メチシリン耐性コアグラーゼ陰性ブドウ球菌、などのメチシリン耐性菌が検出された。ただ、この文具などから院内感染の発生が起こっているかは不明であるが、消毒などの防疫対策の必要性はあるとの報告がなされた。（参考文献：Datz C, Jungwirth A, Dusch H, Galvan G, Weiger T.What's on doctors' ball point pens?.Lancet.1998．Jan17;351(9097):213.）
小児玩具
- 小児科外来、保育所、保育所児の家庭にある絵本、プラスチック製人形、積み木など274検体中を調査したところ、250検体（91.2%）の玩具が細菌に汚染されていた。（参考文献：法橋尚宏、池原恵美子、大森和子「小児玩具の一般細菌汚染に関する調査～小児科外来、保育所、家庭を対象として～」日本環境感染学会、環境感染Vol.20（2）：p.105～111、2005）